得知这个消息，努尔哈赤悲痛万分，他质问明朝的官员，为何杀害他一向效忠明朝的祖父与父亲。明朝官员自觉理亏，不断解释为误杀，并把觉昌安与塔克世的遗体找出来，交还努尔哈赤。努尔哈赤提出交出他的仇人尼堪外兰，让他自行处置，但是明朝官员拒绝了这个要求，只是给予努尔哈赤30道敕书和10匹马，让他承袭了建州左卫指挥使的职务。努尔哈赤明白，此时不能和明朝政府决裂，便接受了明朝的抚慰。几个月之后，努尔哈赤率领百余人攻打尼堪外兰所在的图伦城，拉开了努尔哈赤统一女真各部的历史序幕。由于尼堪外兰是明朝的属官，努尔哈赤的这次进攻也意味着他正式起兵反抗明朝。
努尔哈赤成功地击杀了仇人尼堪外兰。接下来的几年中，努尔哈赤先后打败建州女真各部，逐渐完成了对建州女真的统一。随后，海西女真便成为了努尔哈赤的下一个目标。海西女真主要有乌拉、哈达、叶赫和辉发四部组成。叶赫部看着努尔哈赤逐渐强大，十分惶恐，倡议各部落联合起来，一同攻打努尔哈赤。万历二十一年（1593年），叶赫贝勒纠集了乌拉、哈达、辉发等部组成九部联军3万多人，向建州古勒山发动进攻。面对强大的九部联军，努尔哈赤并不慌张，沉着冷静地给士兵们打气加油，说九部联军只是一群乌合之众，建州兵能以一挡十。第二天，努尔哈赤率军迎战，充分利用地形严密布防，避免与九部联军进行正面交锋。乘其懈怠之时，努尔哈赤率军居高临下发起冲锋，一路砍杀，以少胜多，取得了古勒山大捷。这一战让努尔哈赤名声大振。九部联军的失败，预示着努尔哈赤将最终统一女真各部。