虽然他在大臣们的面前做着独断专行，自信笃定、长谋远略的样子；但事实上在四下无人、独处之时，他感到的是迷惘与自己的微小，只有当他紧紧地抓紧手中的权力时才能有所舒缓，朱由校已经越发的代入皇帝这一角色了。对于此时的明朝来说，改革是一件极其困难的事情。自古以来，一个庞大的组织集团想要进行内部革新，都有一个固定的模式：首先要从组织中挑出不那么腐朽的、健康新鲜的部分，并将其改造以之为核心，去监督管理其他的部分：剔除腐肉，催生出健康的新芽。但是现在大明的政府系统整体已经腐朽了，原有的职能部门中早就没有干净的部分，旧有的体系已经全面的腐烂了，并且正在散发着臭气；新生的血液（锐意进取的年轻官员）不仅无力去扭转溃烂的蔓延，反而正在迅速的被污染、被扼杀。此时的大明就像是一个患了HlV的病人，这是不治之症，它本身并不会导致死亡，但会有着无数的并发症，最终全身都会陷入衰竭，一步步地走向死亡。但朱由校是不是可能把旧体制彻底打破的，因为他就是这个体制的一部分。朱由校只能自己强行将那些新鲜的细胞捏合在一起，生造了一个新的器官，一颗新的心脏，期待着它能为这个垂死的老人注入新的活力，让他重返青春。晚明的失败最直观的是军事上的孱弱，深层的原因是财政的总崩溃，最根本的缘由则是政府失灵与政府停摆。
