所谓谴告说是汉代天人感应说的核心。根据这个学说，自然界的一切灾异，都被解说成了天意的体现，阴阳五行学者即以天意附会人事作为自己的理论宗旨。王充不但因“夫天无为，故不言灾变”，而且以“谴告于天道尤诡，故重论之”[119]。对它进行了重点批驳。灾异说特别重视日食月食，认为这是统治者失德所致。王充抓住这一核心问题，用科学道理阐释：“在天之变，日月薄蚀，四十二月日一食，五月六月月亦一食。食有常数，不在政治。百变千灾，皆同一状，未必人君政教所致。”[120]对于旱灾是天神对君主骄横暴虐的谴责，涝灾是天神对君主迷恋酒色的惩罚，虫食谷物、老虎吃人是天神对官吏为奸的警告等神学呓语，王充逐一用有力的事实做了批驳。他还运用矛盾律对谴告说进行总的清算：“天能谴告人君，则亦能故命圣君。……今则不然，生庸庸之君，失道废德，随谴告之，何天不惮劳也。”[121]对于这个反诘，五行学者是无言以对的。
王充的高明之处还在于他对谴告说追根寻源，对其产生的原因及实质做了人文主义式的考察与说明。他说：“六经之文，圣人之语，动言天者，欲化无道，惧愚者。欲言非独吾心，亦天意也。及其言天，犹以人心，非谓上天苍苍之体也。变复之家，见诬言天，灾异时至，则生谴告之言矣。……上天之心，在圣人之胸，及其谴告，在圣人之口。”[122]这是非常深刻的见解。